De inventaris is onderverdeeld in een persoonlijk gedeelte, waarin alle privé-stukken zijn ondergebracht, en een openbaar of zakelijk gedeelte, waarin alle functies en aanstellingen van Prakke chronologisch zijn gerangschikt. In de laatstgenoemde hoofdrubriek is vanwege de correspondentie en de vele aantekeningen en notities met betrekking tot lezingen, colleges en publicaties, die zich in het archief bevinden, een aparte subrubriek 'Algemeen' gecreëerd. Een deel van de correspondentie werd gesorteerd en op alfabetische volgorde in het archief aangetroffen en is ook zo in de inventaris opgenomen. De schoolschriften waarin Prakke onder andere zijn aantekeningen schreef, zijn uitgesplitst.
Omdat Prakke zich naast zijn hoofdtaken nog met andere zaken en activiteiten bezighield, is er een aparte hoofdrubriek 'Overige activiteiten' opgevoerd. Ten slotte bleek een hoofdrubriek 'Varia' noodzakelijk om de vele in het archief aanwezige, door Prakke bewaarde of verzamelde archivalia en drukwerken te kunnen plaatsen.
In een inventaris van het archief van iemand, die zo totaal met en voor 'het boek' leefde en zoveel gepubliceerd heeft, mag een bibliografie natuurlijk niet ontbreken. De bibliografie geeft niet alleen een overzicht van eigen publicaties, maar ook van publicaties over H.J. Prakke en zijn werk. Hij is in zijn geheel overgenomen uit 'Entgrenzungen. Erinnerungen an Henk Prakke' (Van Gorcum, 2000) en vormt een bijna compleet overzicht - een prestatie van formaat!

Een woord van dank gaat tenslotte uit naar prof. dr. Joan Hemels, dr. Petra Klein en Tjeerd Jongsma voor hun waardevolle informatie en correcties.